Amatitán significa «Pequeño bosque de amates». Sus primeros pobladores eran indígenas nahuatlacas, que se establecieron en el cerro del Chiquihuitillo y se disputaban sus dominios con otros grupos indígenas; según la leyenda estos indígenas tenían un dios que llamaban Titán, al llegar los españoles en el año 1530, los indígenas les decían que no podían amar a otro dios y expresaban «indio ama Titán», por lo que el lugar adquirió el nombre de Amatitán.