El edifico es de tres pisos y está construido con ladrillos cocidos y de intenso color y con cantera gris y roja. Cuenta con distintos estilos arquitectónicos, en el área norte y sur se encuentran elementos de la arquitectura morisca. Asimismo tiene características renacentistas en el primer piso con una decoración Art Nouveau.

Anteriormente en este edificio, en la planta baja, cuando fue usado por los seminaristas, estaban los salones de clases, el comedor, los dormitorios para los filósofos, el aula máxima, los laboratorios de física y química; en el entresuelo, los cuartos de los maestros, de los boticarios, porteros, albañiles, carpinteros y la botica; en el segundo piso, la capilla, la biblioteca, las oficinas del Rector y las del Secretario; en el tercero estaban los observatorios astronómico y meteorológico equipados con anemómetro, veleta, pluviómetro, barómetro, el telescopio con su cúpula giratoria, salones de clase y otras dependencias.